23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2833 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  74.77 
 
 		 349 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  56.46 
 
 		 226 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  54.15 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  55.78 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  49.06 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3682  hypothetical protein  51.96 
 
 		 259 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000140139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  47.12 
 
 		 299 aa  174  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  46.77 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  43.56 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  31.84 
 
 		 197 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  27.22 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  27.22 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  30.12 
 
 		 183 aa  85.5  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1566  hypothetical protein  31.22 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  25.13 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  28.24 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  25.79 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0578  hypothetical protein  36.97 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108637  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  27.37 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  26.32 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  28.18 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  26.42 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>