22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1455 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  35.98 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  32.18 
 
 
234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  32.32 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  31.74 
 
 
349 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  29.94 
 
 
241 aa  84.3  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3682  hypothetical protein  31.03 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000140139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  31.1 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  39.05 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  29.87 
 
 
224 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  30.54 
 
 
299 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  31.54 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  29.51 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  29.94 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  26.58 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  26.58 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0578  hypothetical protein  24.4 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108637  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  23.12 
 
 
203 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>