23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3032 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  92.31 
 
 		 247 aa  440  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  63.18 
 
 		 226 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  56 
 
 		 349 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  54.37 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  51.27 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  46.73 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  42.4 
 
 		 299 aa  171  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3682  hypothetical protein  48.65 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000140139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  45.37 
 
 		 241 aa  168  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  29.65 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  26.63 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  33.89 
 
 		 203 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1566  hypothetical protein  33.14 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  27.84 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  27.84 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  33.9 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0578  hypothetical protein  32.34 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.108637  normal  0.54693 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  29.38 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  29.9 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>