22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0965 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0965  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00137731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2336  hypothetical protein  29.25 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0307  hypothetical protein  26.52 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1455  hypothetical protein  29.51 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0068  hypothetical protein  31.32 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0691082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0164  hypothetical protein  27.84 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3273  hypothetical protein  27.78 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0026213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2833  hypothetical protein  30.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.14005e-16  hitchhiker  0.0000000000194487 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3032  hypothetical protein  28.16 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.574114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2288  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000373742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4684  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000601642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1219  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2222  hypothetical protein  32.14 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000231366  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3682  hypothetical protein  27.65 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000140139  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0315  hypothetical protein  41.38 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0880  hypothetical protein  30.61 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1566  hypothetical protein  42 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0610  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0624  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000644203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0788  hypothetical protein  40.38 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0357  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1791  hypothetical protein  52.63 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00579846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>