15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2644 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2644  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0713606  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  23.84 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4132  hypothetical protein  29.79 
 
 
202 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  27.96 
 
 
185 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  24.34 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7733  hypothetical protein  23.53 
 
 
216 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  30.26 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3291  hypothetical protein  20.34 
 
 
224 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.743277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  28.74 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6394  hypothetical protein  29.3 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  28.15 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  18.84 
 
 
173 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  18.84 
 
 
173 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  22.31 
 
 
179 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  24.14 
 
 
189 aa  41.6  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>