29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4942 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013442  Gbro_4942  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2846  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2458  transposase IS3/IS911 family protein  36.26 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2119  transposase IS3/IS911  34.07 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1573  transposase IS3/IS911  34.07 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8266  hypothetical protein  35.56 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8280  hypothetical protein  36.47 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  30.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  32.22 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  32.22 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25110  Transposase  35.63 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  32.94 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1500  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3370  transposase IS3/IS911 family protein  30.85 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  28.71 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6988  hypothetical protein  31.87 
 
 		 110 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.828918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  31.11 
 
 		 107 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  35.63 
 
 		 108 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17790  Transposase  36.78 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.837137  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2586  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4211  transposase IS3/IS911  34.12 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.892475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  32.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  32.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  32.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  32.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>