85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1493 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1493  DivIVA family protein  100 
 
 
148 aa  293  8e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2723  DivIVA family protein  98.65 
 
 
148 aa  290  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1165  hypothetical protein  68.24 
 
 
149 aa  209  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000872304  hitchhiker  0.00617601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1166  DivIVA family protein  67.57 
 
 
149 aa  207  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0865  cell division protein DivIVA, putative  70.95 
 
 
149 aa  201  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0414  DivIVA family protein  63.45 
 
 
149 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0616  cell division initiation protein, DivIVA-like  53.06 
 
 
181 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2453  DivIVA family protein  45.14 
 
 
184 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12114  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2645  DivIVA family protein  44.44 
 
 
167 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2549  DivIVA family protein  43.75 
 
 
167 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1311  hypothetical protein  43.06 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3636  DivIVA family protein  36.49 
 
 
152 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.212032  normal  0.492397 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1819  cell division protein DivIVA, putative  36.96 
 
 
208 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00249863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2105  putative cell division protein DivIVA  36.96 
 
 
208 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2171  cell-division initiation protein DivIVA  36.3 
 
 
168 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.088633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  35.77 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1695  DivIVA family protein  34.03 
 
 
169 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.625064  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  31.25 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0150  DivIVA family protein  32.64 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0254647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  35.51 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  34.78 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1038  DivIVA family protein  34.78 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  34.03 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  32.35 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  34.03 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2545  DivIVA family protein  34.03 
 
 
168 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109082  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0788  hypothetical protein  31.39 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000906817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  29.93 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09260  DivIVA family protein  31.97 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00480127  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1690  DivIVA family protein  32.88 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.519354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0716  DivIVA family protein  34.58 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2262  DivIVA domain protein  32.37 
 
 
168 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  36.56 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2359  DivIVA family protein  33.08 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.038751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1264  DivIVA family protein  28.26 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.746002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  30.97 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  26.45 
 
 
290 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0600  DivIVA family protein  29.84 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00107813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  34.23 
 
 
289 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0597  DivIVA family protein  32.17 
 
 
246 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000335111  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1427  hypothetical protein  30.14 
 
 
255 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.137686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2890  DivIVA family protein  35.14 
 
 
344 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0862  hypothetical protein  31.13 
 
 
184 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00599598  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0757  cell-division initiation protein, putative  25.69 
 
 
218 aa  57  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.04044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  27.48 
 
 
291 aa  57  0.00000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  31.06 
 
 
302 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  26.9 
 
 
211 aa  54.7  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3443  DivIVA family protein  22.63 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1835  hypothetical protein  29.46 
 
 
181 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.621323 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0958  cell division initiation protein  31.58 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0429766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1488  cell division initiation protein  28.75 
 
 
220 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  31.2 
 
 
218 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5835  DivIVA domain protein  30.52 
 
 
298 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2167  DivIVA family protein  26.21 
 
 
302 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1197  cell division initiation protein  26.29 
 
 
263 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0484  cell division protein DivIVA, putative  26.95 
 
 
256 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1276  hypothetical protein  25.69 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0323944  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1251  hypothetical protein  25.69 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00102794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0848  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  30.34 
 
 
273 aa  43.9  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  40.38 
 
 
292 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  40 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  40.38 
 
 
289 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  37.04 
 
 
260 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  40.38 
 
 
280 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  24.89 
 
 
270 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  40 
 
 
240 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  40.38 
 
 
291 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  37.74 
 
 
276 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  40.38 
 
 
285 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  35.19 
 
 
274 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  34.69 
 
 
254 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  35.85 
 
 
271 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  35.85 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  35.85 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  35.85 
 
 
272 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  28.17 
 
 
266 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>