78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1165 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1165  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  297  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000872304  hitchhiker  0.00617601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0865  cell division protein DivIVA, putative  72.97 
 
 
149 aa  231  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1166  DivIVA family protein  67.11 
 
 
149 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1493  DivIVA family protein  68.24 
 
 
148 aa  209  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2723  DivIVA family protein  67.57 
 
 
148 aa  206  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0414  DivIVA family protein  64.43 
 
 
149 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000218061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0616  cell division initiation protein, DivIVA-like  45.58 
 
 
181 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2549  DivIVA family protein  44.44 
 
 
167 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2645  DivIVA family protein  43.75 
 
 
167 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1311  hypothetical protein  43.75 
 
 
167 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2453  DivIVA family protein  42.36 
 
 
184 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12114  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3636  DivIVA family protein  36.05 
 
 
152 aa  101  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.212032  normal  0.492397 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1819  cell division protein DivIVA, putative  34.78 
 
 
208 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00249863  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2105  putative cell division protein DivIVA  34.78 
 
 
208 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1319  DivIVA family protein  33.78 
 
 
199 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.290903  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1908  DivIVA domain protein  35.42 
 
 
170 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  34.69 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1297  DivIVA domain protein  32.64 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2171  cell-division initiation protein DivIVA  32.88 
 
 
168 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.088633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4043  DivIVA family protein  34.31 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000426575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1038  DivIVA family protein  33.33 
 
 
170 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  33.11 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  33.11 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  32.43 
 
 
168 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  32.43 
 
 
168 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2545  DivIVA family protein  32.43 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109082  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1695  DivIVA family protein  31.25 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.625064  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0150  DivIVA family protein  30.2 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0254647 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1348  DivIVA family protein  31.39 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0254169  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09260  DivIVA family protein  32.21 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00480127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0788  hypothetical protein  29.2 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000906817  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1427  hypothetical protein  33.57 
 
 
255 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.137686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1264  DivIVA family protein  29.58 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.746002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0862  hypothetical protein  32.84 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00599598  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1410  DivIVA family protein  30.51 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000103103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1483  hypothetical protein  25.81 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.727483  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2359  DivIVA family protein  34.33 
 
 
312 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.038751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0716  DivIVA family protein  29.27 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1087  DivIVA family protein  31.86 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000386822  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0597  DivIVA family protein  27.04 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000335111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1690  DivIVA family protein  28.17 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0149301  normal  0.519354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0757  cell-division initiation protein, putative  28.47 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.04044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0782  cell division initiation protein  30.53 
 
 
291 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.343378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0760  cell division initiation protein  33.33 
 
 
289 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0600  DivIVA family protein  25.95 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00107813  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0958  cell division initiation protein  35.79 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0429766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2890  DivIVA family protein  34.04 
 
 
344 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3443  DivIVA family protein  25.69 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2262  DivIVA domain protein  27.4 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5835  DivIVA domain protein  34.51 
 
 
298 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0917921  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  34.45 
 
 
218 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1835  hypothetical protein  32.54 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.621323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1488  cell division initiation protein  28.93 
 
 
220 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1027  DivIVA family protein  32.58 
 
 
302 aa  53.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.681313  decreased coverage  0.00235736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2167  DivIVA family protein  27.52 
 
 
302 aa  53.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.866621  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1251  hypothetical protein  27.08 
 
 
205 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00102794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1276  hypothetical protein  27.08 
 
 
205 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0323944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0484  cell division protein DivIVA, putative  25.97 
 
 
256 aa  50.4  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0494  DivIVA family protein  26.38 
 
 
211 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.793084  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  43.64 
 
 
271 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1197  cell division initiation protein  26.36 
 
 
263 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.103565  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1118  hypothetical protein  40 
 
 
280 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.142356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0905  DivIVA domain protein  41.67 
 
 
291 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0130054  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2919  DivIVA family protein  41.67 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000529899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2878  hypothetical protein  41.67 
 
 
285 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679159  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  44 
 
 
240 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  43.4 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1414  DivIVA family protein  38.67 
 
 
289 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.117055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  36.07 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  37.74 
 
 
276 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0923  cell division protein GpsB  30.77 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.932524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  35.85 
 
 
271 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>