28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_R0115 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0115  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0120  tRNA-Ala  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0016  tRNA-Ala  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0028  tRNA-Ala  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.148209  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0028  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.20827  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0385641  normal  0.0854931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0002  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555494 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04600  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00080  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000907858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28340  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.146579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0041  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0055  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100813  normal  0.0566569 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113148  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0051  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114614  normal  0.0557031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0023  tRNA-Val  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000500863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0047  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0721509  normal  0.0848173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000428882  hitchhiker  0.00000000692947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0036  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0085  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00934773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0077  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000402465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0069  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0057  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288839  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0037  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000412611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0013  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000457589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0003  tRNA-Ala  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00193312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0025  tRNA-Val  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000443719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>