36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0435 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0435  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  708    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2194  hypothetical protein  60.29 
 
 
350 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3806  hypothetical protein  38.26 
 
 
353 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646407  hitchhiker  9.69016e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1539  hypothetical protein  38.55 
 
 
353 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000431521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1406  hypothetical protein  38.55 
 
 
353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000364986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1393  hypothetical protein  38.26 
 
 
357 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1504  hypothetical protein  38.26 
 
 
353 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000086272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1645  hypothetical protein  38 
 
 
353 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000324872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1366  hypothetical protein  37.68 
 
 
353 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1365  hypothetical protein  37.97 
 
 
353 aa  230  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000244018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1578  hypothetical protein  37.68 
 
 
353 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87864e-41 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1608  hypothetical protein  37.68 
 
 
353 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1207  hypothetical protein  36.71 
 
 
353 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000276543  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1570  hypothetical protein  24.01 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1539  hypothetical protein  24.01 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.44 
 
 
728 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0759  hypothetical protein  23.55 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 
709 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.94 
 
 
707 aa  50.1  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1050  hypothetical protein  21.16 
 
 
320 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 
705 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.67 
 
 
709 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.67 
 
 
709 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  36.56 
 
 
705 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
706 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  36.05 
 
 
705 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.34 
 
 
705 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1376  HRDC domain protein  28.12 
 
 
829 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  25.56 
 
 
714 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>