33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2194 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2194  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  721    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0435  hypothetical protein  60.29 
 
 
348 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1539  hypothetical protein  39.47 
 
 
353 aa  255  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000431521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1608  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3806  hypothetical protein  39.47 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646407  hitchhiker  9.69016e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1393  hypothetical protein  39.18 
 
 
357 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1504  hypothetical protein  39.18 
 
 
353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000086272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1406  hypothetical protein  38.6 
 
 
353 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000364986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1207  hypothetical protein  39.65 
 
 
353 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000276543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1578  hypothetical protein  39.77 
 
 
353 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87864e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1645  hypothetical protein  39.18 
 
 
353 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000324872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1366  hypothetical protein  39.47 
 
 
353 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129131  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1365  hypothetical protein  39.47 
 
 
353 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000244018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0759  hypothetical protein  23.29 
 
 
341 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458376  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1050  hypothetical protein  26.4 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.336986  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1427  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.14 
 
 
709 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.63 
 
 
728 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1539  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1570  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4935  5'-3' DNA helicase  33.33 
 
 
734 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.05 
 
 
705 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
706 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
705 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0207  AAA ATPase  31.71 
 
 
764 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
705 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  33.72 
 
 
705 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  28.75 
 
 
707 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1570  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.16 
 
 
722 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>