26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3311 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3311  uncharacterized small membrane protein  100 
 
 
73 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000828544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3423  hypothetical protein  68.49 
 
 
73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3833  hypothetical protein  58.9 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000000983405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5404  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.398170000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5516  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314928  hitchhiker  1.59105e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5435  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000545162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5491  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000446823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5163  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5111  hypothetical protein  57.53 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000359017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5438  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5555  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5013  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4996  hypothetical protein  57.75 
 
 
84 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.60678e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4173  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00132709  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1607  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3158  hypothetical protein  51.35 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2389  hypothetical protein  52.78 
 
 
87 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0628  hypothetical protein  30.88 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000380142  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2386  hypothetical protein  36.96 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0414094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4013  hypothetical protein  34.48 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0013  hypothetical protein  36.21 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2797  ATP synthase protein I  29.58 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0200156  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3929  hypothetical protein  32.76 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000115703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2595  ATP synthase F0, subunit I  38.46 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1943  hypothetical protein  38.3 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_496  hypothetical protein  44.19 
 
 
77 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000000569038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>