44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3026 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3026  flagellar protein FlbD, putative  100 
 
 		 92 aa  189  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0462  flagellar protein  60.47 
 
 		 87 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4078  flagellar FlbD family protein  58.82 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.678438  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3753  flagellar FlbD family protein  49.41 
 
 		 85 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3837  flagellar FlbD family protein  49.41 
 
 		 89 aa  89.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0032  flagellar FlbD family protein  47.5 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0256  flagellar FlbD family protein  49.15 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0254  flagellar FlbD family protein  49.15 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2041  flagellar FlbD family protein  45.16 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.250261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3472  flagellar FlbD family protein  44.93 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1659  flagellar FlbD family protein  45.16 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2982  flagellar FlbD family protein  46.77 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.31027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1536  flagellar FlbD family protein  44.07 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0969  flagellar FlbD family protein  35.23 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1327  flagellar FlbD family protein  47.27 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1294  flagellar FlbD family protein  40.68 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1401  flagellar FlbD family protein  43.94 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.207485  normal  0.631836 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0288  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4145  flagellar FlbD family protein  43.64 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2163  flagellar FlbD family protein  40 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1683  flagellar FlbD family protein  42.37 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16790  flagellar FlbD family protein  36.21 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000248236  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0750  flagellar FlbD family protein  42.37 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1400  flagellar FlbD family protein  44.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0859  hypothetical protein  45.61 
 
 		 73 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1016  flagellar FlbD family protein  37.29 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2018  flagellar FlbD family protein  38.71 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2707  flagellar FlbD family protein  40.91 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1386  flagellar protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2471  flagellar FlbD family protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2567  flagellar FlbD family protein  43.1 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2012  flagellar FlbD family protein  42.59 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0051  flagellar FlbD family protein  34.85 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0109  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000361803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0850  flagellar FlbD family protein  46.77 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.718812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2767  flagellar protein-related protein  32.76 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000927722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0780  flagellar  35 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00539168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1120  flagellar FlbD family protein  43.75 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2338  flagellar FlbD family protein  32.97 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31130  uncharacterized protein, possibly involved in motility  35.59 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188093  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0475  flagellar protein  57.14 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000157242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1314  flagellar FlbD family protein  36.67 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2934  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0146  flagellar FlbD family protein  46.51 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>