41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2018 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2018  flagellar FlbD family protein  100 
 
 
87 aa  174  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184635  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31130  uncharacterized protein, possibly involved in motility  60.92 
 
 
88 aa  106  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188093  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0969  flagellar FlbD family protein  56.76 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1659  flagellar FlbD family protein  51.39 
 
 
105 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2982  flagellar FlbD family protein  52.31 
 
 
81 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.31027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2338  flagellar FlbD family protein  49.21 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0850  flagellar FlbD family protein  59.68 
 
 
117 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.718812  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0750  flagellar FlbD family protein  48.33 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0462  flagellar protein  44.44 
 
 
87 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2041  flagellar FlbD family protein  45.31 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.250261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1401  flagellar FlbD family protein  48.28 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.207485  normal  0.631836 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1120  flagellar FlbD family protein  46.15 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0256  flagellar FlbD family protein  47.92 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0254  flagellar FlbD family protein  47.92 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4145  flagellar FlbD family protein  47.92 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1294  flagellar FlbD family protein  38.33 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0288  hypothetical protein  35.62 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2707  flagellar FlbD family protein  41.94 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0109  flagellar FlbD family protein  44.68 
 
 
61 aa  52  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000361803  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1314  flagellar FlbD family protein  40 
 
 
97 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1536  flagellar FlbD family protein  37.29 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2012  flagellar FlbD family protein  39.34 
 
 
74 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3026  flagellar protein FlbD, putative  38.71 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4078  flagellar FlbD family protein  40.32 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.678438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2163  flagellar FlbD family protein  42.86 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1683  flagellar FlbD family protein  37.31 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0032  flagellar FlbD family protein  35.82 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3472  flagellar FlbD family protein  35.48 
 
 
106 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2767  flagellar protein-related protein  36.21 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000927722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0051  flagellar FlbD family protein  35.71 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1327  flagellar FlbD family protein  33.33 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0859  hypothetical protein  38.3 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3753  flagellar FlbD family protein  39.13 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0146  flagellar FlbD family protein  41.86 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3837  flagellar FlbD family protein  39.13 
 
 
89 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2934  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0780  flagellar  37.29 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00539168  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1386  flagellar protein  33.33 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2567  flagellar FlbD family protein  33.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2471  flagellar FlbD family protein  33.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.868269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1400  flagellar FlbD family protein  42.86 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>