24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1314 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1314  flagellar FlbD family protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0969  flagellar FlbD family protein  45.26 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2018  flagellar FlbD family protein  40 
 
 
87 aa  52  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184635  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2982  flagellar FlbD family protein  40.24 
 
 
81 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.31027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1659  flagellar FlbD family protein  33.82 
 
 
105 aa  50.1  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2012  flagellar FlbD family protein  45.28 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1536  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1120  flagellar FlbD family protein  35.44 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2338  flagellar FlbD family protein  38.71 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4145  flagellar FlbD family protein  41.51 
 
 
75 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31130  uncharacterized protein, possibly involved in motility  28.57 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188093  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1294  flagellar FlbD family protein  30 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0850  flagellar FlbD family protein  47.76 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.718812  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0288  hypothetical protein  35.29 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1400  flagellar FlbD family protein  41.27 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0109  flagellar FlbD family protein  33.96 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000361803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2041  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.250261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0750  flagellar FlbD family protein  35.63 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2163  flagellar FlbD family protein  33.9 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0256  flagellar FlbD family protein  33.87 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0254  flagellar FlbD family protein  33.87 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0146  flagellar FlbD family protein  51.16 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3026  flagellar protein FlbD, putative  36.67 
 
 
92 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0462  flagellar protein  38.98 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>