36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3837 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3837  flagellar FlbD family protein  100 
 
 
89 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3753  flagellar FlbD family protein  97.65 
 
 
85 aa  173  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4078  flagellar FlbD family protein  57.65 
 
 
85 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.678438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0462  flagellar protein  54.12 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3026  flagellar protein FlbD, putative  49.41 
 
 
92 aa  89.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0032  flagellar FlbD family protein  45.88 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3472  flagellar FlbD family protein  44.87 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2982  flagellar FlbD family protein  46.77 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.31027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1536  flagellar FlbD family protein  44.07 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4145  flagellar FlbD family protein  47.37 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0254  flagellar FlbD family protein  42.37 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0256  flagellar FlbD family protein  42.37 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1659  flagellar FlbD family protein  42.03 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1294  flagellar FlbD family protein  42.62 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1327  flagellar FlbD family protein  40.68 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2041  flagellar FlbD family protein  41.94 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.250261  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1401  flagellar FlbD family protein  45.45 
 
 
80 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.207485  normal  0.631836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0780  flagellar  41.67 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00539168  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16790  flagellar FlbD family protein  37.29 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000248236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0051  flagellar FlbD family protein  38.24 
 
 
115 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0969  flagellar FlbD family protein  38.71 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2018  flagellar FlbD family protein  39.13 
 
 
87 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184635  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1016  flagellar FlbD family protein  35.59 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1400  flagellar FlbD family protein  39.22 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1683  flagellar FlbD family protein  37.29 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2163  flagellar FlbD family protein  36.67 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0850  flagellar FlbD family protein  45.76 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.718812  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2012  flagellar FlbD family protein  37.93 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0288  hypothetical protein  39.71 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31130  uncharacterized protein, possibly involved in motility  33.9 
 
 
88 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188093  normal  0.175226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0859  hypothetical protein  35.09 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0146  flagellar FlbD family protein  52.38 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0750  flagellar FlbD family protein  33.9 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1120  flagellar FlbD family protein  43.4 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2707  flagellar FlbD family protein  37.5 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0109  flagellar FlbD family protein  36.07 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000361803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>