18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2503 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2503  cytochrome c family protein  100 
 
 		 430 aa  895    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0701  cytochrome c family protein  63.72 
 
 		 427 aa  570  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2504  cytochrome c family protein  60.77 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1989  hypothetical protein  51.53 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1116  cytochrome c family protein  49.78 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.598928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2501  cytochrome c family protein  49.29 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2680  cytochrome c family protein  50 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2679  cytochrome c family protein  46.98 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1830  cytochrome c family protein  50.11 
 
 		 458 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2004  hypothetical protein  46.12 
 
 		 408 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3257  cytochrome c family protein  47.42 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3064  cytochrome c family protein  46.95 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3162  cytochrome c family protein  46.95 
 
 		 422 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1117  cytochrome c family protein  44.37 
 
 		 444 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.909835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1131  cytochrome c family protein  46.63 
 
 		 436 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000220397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3074  cytochrome c family protein  40.04 
 
 		 436 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.479683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3172  cytochrome c family protein  39.61 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3267  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 440 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>