15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2427 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2427  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0817  hypothetical protein  90.62 
 
 
128 aa  246  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000292272  hitchhiker  0.000000768669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1466  hypothetical protein  79.67 
 
 
126 aa  215  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2703  hypothetical protein  73.83 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000598059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1537  hypothetical protein  73.83 
 
 
130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.25022e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2823  hypothetical protein  58.12 
 
 
124 aa  159  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4266  hypothetical protein  59.13 
 
 
128 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3086  hypothetical protein  53.33 
 
 
128 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000398184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3205  hypothetical protein  52.78 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3068  hypothetical protein  34.26 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1272  hypothetical protein  33 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0626591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1881  hypothetical protein  33.98 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.770228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2464  hypothetical protein  32.99 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.24437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1087  hypothetical protein  32.38 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0083  hypothetical protein  25.24 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.215487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>