15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2703 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2703  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  270  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000598059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1537  hypothetical protein  99.23 
 
 		 130 aa  269  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.25022e-35 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2427  hypothetical protein  73.11 
 
 		 128 aa  187  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0817  hypothetical protein  70.08 
 
 		 128 aa  186  8e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000292272  hitchhiker  0.000000768669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4266  hypothetical protein  61.9 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1466  hypothetical protein  63.78 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2823  hypothetical protein  61.79 
 
 		 124 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3086  hypothetical protein  49.22 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000398184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3205  hypothetical protein  48.6 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2464  hypothetical protein  34.17 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.24437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1881  hypothetical protein  33.01 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.770228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3068  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1272  hypothetical protein  29.25 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0626591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1087  hypothetical protein  29.41 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0083  hypothetical protein  23.76 
 
 		 106 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.215487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>