15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1466 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1466  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  264  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0817  hypothetical protein  82.81 
 
 
128 aa  226  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000292272  hitchhiker  0.000000768669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2427  hypothetical protein  79.67 
 
 
128 aa  215  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2703  hypothetical protein  69.16 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000598059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4266  hypothetical protein  59.68 
 
 
128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1537  hypothetical protein  69.16 
 
 
130 aa  163  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.25022e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2823  hypothetical protein  50.83 
 
 
124 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3086  hypothetical protein  48.36 
 
 
128 aa  129  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000398184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3205  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1881  hypothetical protein  31.19 
 
 
125 aa  62  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.770228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3068  hypothetical protein  31.48 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1272  hypothetical protein  31.19 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0626591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2464  hypothetical protein  27.83 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.24437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1087  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0083  hypothetical protein  26.21 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.215487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>