13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1881 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1881  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.770228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3068  hypothetical protein  81.31 
 
 
125 aa  189  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1272  hypothetical protein  61.67 
 
 
123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0626591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2464  hypothetical protein  57.85 
 
 
126 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.24437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2427  hypothetical protein  33.98 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000292272  hitchhiker  0.000000768669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1466  hypothetical protein  31.19 
 
 
126 aa  62  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4266  hypothetical protein  28.07 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2823  hypothetical protein  34.12 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2703  hypothetical protein  33.66 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000598059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1537  hypothetical protein  33.66 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.25022e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3086  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000398184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3205  hypothetical protein  30 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>