19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3691 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3691  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0652  hypothetical protein  31.67 
 
 
216 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2721  hypothetical protein  30.81 
 
 
205 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242146  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0656  hypothetical protein  34.27 
 
 
204 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000158351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0781  hypothetical protein  34.27 
 
 
204 aa  98.6  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000208044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3062  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2120  hypothetical protein  29.36 
 
 
208 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000120456  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1284  hypothetical protein  30.85 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2116  hypothetical protein  30.85 
 
 
220 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0212  hypothetical protein  34.87 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.017642  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2660  hypothetical protein  31.5 
 
 
206 aa  93.6  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4520  hypothetical protein  30.35 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.626432  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2914  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0442485  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4126  hypothetical protein  31.28 
 
 
206 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2073  hypothetical protein  29.77 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0007392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3030  hypothetical protein  28.37 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0648  hypothetical protein  26.61 
 
 
208 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1659  hypothetical protein  30.95 
 
 
206 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2282  hypothetical protein  28.03 
 
 
151 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>