20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1659 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1659  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  414  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0212  hypothetical protein  60.8 
 
 
212 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.017642  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2721  hypothetical protein  59.22 
 
 
205 aa  248  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242146  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2120  hypothetical protein  50.75 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000120456  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2073  hypothetical protein  49.05 
 
 
211 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0007392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2660  hypothetical protein  50.24 
 
 
206 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0648  hypothetical protein  49 
 
 
208 aa  205  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4126  hypothetical protein  51.5 
 
 
206 aa  201  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2914  hypothetical protein  51.5 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0442485  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0656  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000158351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0781  hypothetical protein  50 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000208044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2282  hypothetical protein  57.72 
 
 
151 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3062  hypothetical protein  43.01 
 
 
217 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0652  hypothetical protein  39.8 
 
 
216 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2116  hypothetical protein  41.9 
 
 
220 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1284  hypothetical protein  41.9 
 
 
220 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4520  hypothetical protein  39.69 
 
 
219 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.626432  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3030  hypothetical protein  35.57 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3691  hypothetical protein  30.95 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2279  hypothetical protein  54.17 
 
 
61 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>