19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3062 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3030  hypothetical protein  56.94 
 
 		 217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1284  hypothetical protein  58.33 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2116  hypothetical protein  58.33 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4520  hypothetical protein  56.86 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.626432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0652  hypothetical protein  54.63 
 
 		 216 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0212  hypothetical protein  44.56 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.017642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1659  hypothetical protein  43.01 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2721  hypothetical protein  39.8 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4126  hypothetical protein  41.09 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2914  hypothetical protein  40.59 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0442485  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2073  hypothetical protein  40 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0007392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2120  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000120456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2660  hypothetical protein  37.56 
 
 		 206 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2282  hypothetical protein  45.95 
 
 		 151 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0648  hypothetical protein  37.78 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0781  hypothetical protein  37.76 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000208044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0656  hypothetical protein  37.76 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000158351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3691  hypothetical protein  29.05 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>