15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7221 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7221  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  696    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0813175  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0087  dehydrogenases and related proteins-like  77.12 
 
 
376 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  23.28 
 
 
328 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1860  oxidoreductase domain-containing protein  34.04 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123428  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4901  oxidoreductase domain protein  43.75 
 
 
319 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1245  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.38 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  39.08 
 
 
667 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2682  oxidoreductase domain-containing protein  29.75 
 
 
381 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.404123  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1858  putative oxidoreductase  37.61 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.371104  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1665  oxidoreductase  35.96 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.351306 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4436  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 
390 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  29.17 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  20.82 
 
 
327 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>