34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1295 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1295  methyltransferase FkbM  100 
 
 
296 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2162  methyltransferase FkbM family  25.38 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0352  methyltransferase FkbM family  26.84 
 
 
256 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000196185  normal  0.401562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4823  FkbM family methyltransferase  33.52 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80826  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0207  methyltransferase FkbM  28.97 
 
 
235 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339437  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0751  methyltransferase FkbM  23.42 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  21.61 
 
 
488 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0743  FkbM family methyltransferase  28.02 
 
 
661 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.70648  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1470  FkbM family methyltransferase  30.07 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.684479  normal  0.1078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4929  hypothetical protein  35.92 
 
 
255 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0726725  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1152  hypothetical protein  36.3 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1702  methyltransferase FkbM family  42.03 
 
 
277 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0386  methyltransferase FkbM family  25.33 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2142  FkbM family methyltransferase  31.91 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  31.74 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0395  methyltransferase FkbM family  25.33 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  29.53 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3172  methyltransferase FkbM family  28.18 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4981  hypothetical protein  21.58 
 
 
625 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2091  FkbM family methyltransferase  32.65 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0747  methyltransferase FkbM  34.92 
 
 
306 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  44.3 
 
 
192 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  22.37 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2076  FkbM family methyltransferase  51.16 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.503081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1173  methyltransferase FkbM  25.66 
 
 
255 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.764759  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0294  FkbM family methyltransferase  40 
 
 
454 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.314449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  46.67 
 
 
195 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0453  methyltransferase FkbM family  24.19 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2867  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  hitchhiker  0.00138469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3254  methyltransferase FkbM family  25 
 
 
386 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4024  methyltransferase FkbM family  25.17 
 
 
351 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0297  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
279 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3801  putative methyltransferase FkbM  29.3 
 
 
239 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.403441  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1155  FkbM family methyltransferase  36.07 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>