242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0691 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0691  purine nucleoside phosphorylase  100 
 
 		 290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.340478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5925  purine nucleotide phosphorylase  79.13 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1244  purine nucleoside phosphorylase  67.44 
 
 		 283 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1261  purine nucleoside phosphorylase  67.44 
 
 		 264 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.531901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6421  purine nucleotide phosphorylase  65.08 
 
 		 270 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1610  purine nucleoside phosphorylase  63.81 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13336  purine nucleoside phosphorylase  64.73 
 
 		 268 aa  311  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1271  purine nucleoside phosphorylase  66 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1788  purine nucleotide phosphorylase  65.71 
 
 		 267 aa  309  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4828  purine nucleoside phosphorylase  62.17 
 
 		 264 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.912849 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0983  purine nucleotide phosphorylase  66.4 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05630  purine nucleotide phosphorylase  61.15 
 
 		 268 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1353  purine nucleotide phosphorylase  60.07 
 
 		 269 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264774  normal  0.707777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0804  purine nucleotide phosphorylase  59 
 
 		 269 aa  285  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.506709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3521  purine nucleoside phosphorylase  57.55 
 
 		 273 aa  280  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.190992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0687  purine nucleotide phosphorylase  59.7 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2242  purine nucleoside phosphorylase  61.2 
 
 		 265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4378  purine nucleotide phosphorylase  62.86 
 
 		 269 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3246  purine nucleotide phosphorylase  61.11 
 
 		 265 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4182  purine nucleotide phosphorylase  60.08 
 
 		 265 aa  265  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.582095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1031  purine nucleotide phosphorylase  56.06 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.562427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1283  hypothetical protein  52.78 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08170  purine nucleotide phosphorylase  53.36 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323774  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2933  purine nucleotide phosphorylase  53.45 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  hitchhiker  0.000391554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1006  purine nucleotide phosphorylase  55.89 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1262  purine nucleoside phosphorylase  53.33 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1308  purine nucleoside phosphorylase  52.16 
 
 		 272 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016301 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3920  purine nucleotide phosphorylase  55.47 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0633708  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25580  purine nucleotide phosphorylase  51.96 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.895819  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05610  purine nucleotide phosphorylase  54.37 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393553  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0835  purine nucleotide phosphorylase  51.87 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.618854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21180  purine nucleotide phosphorylase  50 
 
 		 287 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3952  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  49.22 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0777  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  41.57 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1772  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  38.1 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0373  purine nucleoside phosphorylase  37.19 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1088  purine nucleoside phosphorylase  38.04 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1032  purine nucleoside phosphorylase  38.04 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3917  purine nucleoside phosphorylase  38.82 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255669  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3827  purine nucleoside phosphorylase  38.82 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0369  purine nucleoside phosphorylase  43.16 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4155  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.127782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3996  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.687151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3843  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.652897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4196  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4308  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0248075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4219  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000140945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4110  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.82826e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1041  purine nucleoside phosphorylase  38.43 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00686248  hitchhiker  0.0000807252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0852  purine nucleoside phosphorylase  37.4 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2785  purine nucleoside phosphorylase  37.65 
 
 		 273 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000440392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1666  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.24 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.321595  normal  0.0366177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1201  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  39.13 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.202694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2255  purine nucleoside phosphorylase  38.98 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2032  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  38.1 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2818  purine nucleoside phosphorylase  35.25 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1371  purine nucleoside phosphorylase  38.25 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.584924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1022  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  44.44 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0711596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3055  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  37.77 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.089752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0663  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  44.49 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0601397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6092  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  40.3 
 
 		 275 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1655  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  42.41 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441226  hitchhiker  0.00385339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3448  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  39.34 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2504  purine nucleoside phosphorylase  35.15 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2018  purine nucleoside phosphorylase  41.13 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0618  inosine, guanosine, xanthosine phosphorylase  41.96 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1936  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  35.32 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1783  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  33.86 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2966  purine nucleoside phosphorylase  41.41 
 
 		 270 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0249525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3925  purine nucleoside phosphorylase  45.1 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.860697  normal  0.9635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2264  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  42.86 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3148  purine nucleoside phosphorylase  41.5 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1299  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  40.86 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.78 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1259  purine nucleoside phosphorylase  38.84 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0652  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.78 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0762  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  39.3 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.831792  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0263  purine nucleoside phosphorylase  39.76 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4255  purine nucleoside phosphorylase  39.6 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0509  purine nucleoside phosphorylase  43.67 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2911  purine nucleoside phosphorylase  37.94 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2824  purine nucleoside phosphorylase  37.94 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08880  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  43.69 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00712876  normal  0.676601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4175  purine nucleoside phosphorylase  38.64 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1011  purine nucleoside phosphorylase  38.21 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1703  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.08 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.423097  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0821  purine nucleoside phosphorylase  38.11 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834093 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0630  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  33.33 
 
 		 273 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0264  purine nucleoside phosphorylase  34.36 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1075  purine nucleoside phosphorylase  36.84 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4463  purine nucleoside phosphorylase  38.26 
 
 		 266 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316859  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1889  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  36 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000110705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3656  purine nucleoside phosphorylase  41.67 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0606  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family protein  33.46 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1012  inosine guanosine and xanthosine phosphorylase family  40.43 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06960  purine nucleoside phosphorylase I, inosine and guanosine-specific  36.68 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2286  purine nucleoside phosphorylase  44.39 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.667426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1196  purine nucleoside phosphorylase  37.6 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0130681  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0461  purine nucleoside phosphorylase  37.5 
 
 		 303 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1537  purine nucleoside phosphorylase  37.87 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.278191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>