27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1555 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1555  curli assembly protein CsgE  100 
 
 
129 aa  266  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271531  normal  0.205881 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2606  regulator of chromosome condensation RCC1  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0218949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01043  hypothetical protein  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1418  curli assembly protein CsgE  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0884878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2094  curli assembly protein CsgE  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.769765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2560  curli assembly protein CsgE  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1158  curli assembly protein CsgE  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1157  curli assembly protein CsgE  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01036  predicted transport protein  83.72 
 
 
129 aa  229  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2049  curli assembly protein CsgE  80.15 
 
 
131 aa  221  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1207  curli assembly protein CsgE  79.39 
 
 
131 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.257586  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1252  curli assembly protein CsgE  79.39 
 
 
131 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.574024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1237  curli assembly protein CsgE  79.39 
 
 
131 aa  220  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312538  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2232  curli assembly protein CsgE  78.63 
 
 
131 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.917805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2472  curli assembly protein CsgE  37.96 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768974  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2297  curli assembly protein CsgE  35.19 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3474  curli assembly protein CsgE  35.19 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443739  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2463  curli assembly protein CsgE  35.65 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1991  curli assembly protein CsgE  37.74 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0133038  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2857  assembly/transport component in curli production, CsgE precursor  35.92 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2290  curli production assembly/transport component CsgE  71.79 
 
 
40 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01504  curli production assembly/transport component  32.14 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1518  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.5509  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2586  hypothetical protein  35.9 
 
 
201 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1818  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.103133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1727  hypothetical protein  32.41 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0969  curli production assembly/transport component CsgE, putative  33.71 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>