22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1518 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.5509  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1818  hypothetical protein  68.61 
 
 		 153 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.103133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1727  hypothetical protein  69.67 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2857  assembly/transport component in curli production, CsgE precursor  36.11 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1555  curli assembly protein CsgE  32.41 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271531  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2560  curli assembly protein CsgE  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01043  hypothetical protein  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1418  curli assembly protein CsgE  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0884878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2049  curli assembly protein CsgE  31.82 
 
 		 131 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2094  curli assembly protein CsgE  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769765 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01036  predicted transport protein  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1158  curli assembly protein CsgE  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1157  curli assembly protein CsgE  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2606  regulator of chromosome condensation RCC1  32.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0218949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1237  curli assembly protein CsgE  31.82 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1252  curli assembly protein CsgE  31.82 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.574024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1207  curli assembly protein CsgE  31.82 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.257586  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2232  curli assembly protein CsgE  30.91 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.917805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1991  curli assembly protein CsgE  29.59 
 
 		 130 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0133038  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2297  curli assembly protein CsgE  29.47 
 
 		 133 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3474  curli assembly protein CsgE  29.47 
 
 		 133 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443739  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2472  curli assembly protein CsgE  29.52 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.768974  normal  0.307548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>