30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01504 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01504  curli production assembly/transport component  100 
 
 		 130 aa  266  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1003  curli production assembly/transport component CsgE, putative  36.21 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3154  curli production assembly/transport component CsgE, putative  33.33 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2986  curli production assembly/transport component CsgE, putative  36.21 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1024  curli production assembly/transport component CsgE, putative  35.34 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1036  curli production assembly/transport component CsgE, putative  35.34 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.730845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0868  curli production assembly/transport component CsgE, putative  35.58 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3336  curli production assembly/transport component CsgE, putative  35.34 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3255  curli production assembly/transport component CsgE, putative  35.58 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0969  curli production assembly/transport component CsgE, putative  32.58 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0641  curli production assembly/transport component CsgE, putative  34.91 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000725097  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3687  curli production assembly/transport component CsgE, putative  33.94 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2859  curli production assembly/transport component CsgE, putative  36.26 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1555  curli assembly protein CsgE  32.14 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.271531  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2094  curli assembly protein CsgE  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1158  curli assembly protein CsgE  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1418  curli assembly protein CsgE  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0884878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01043  hypothetical protein  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.582355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2560  curli assembly protein CsgE  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.373691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01036  predicted transport protein  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1157  curli assembly protein CsgE  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.471296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2606  regulator of chromosome condensation RCC1  28.45 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0218949  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2049  curli assembly protein CsgE  28.81 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1237  curli assembly protein CsgE  27.97 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1252  curli assembly protein CsgE  27.97 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.574024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1207  curli assembly protein CsgE  27.97 
 
 		 131 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.257586  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2857  assembly/transport component in curli production, CsgE precursor  29.76 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.121415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2232  curli assembly protein CsgE  27.12 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.917805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1991  curli assembly protein CsgE  29.36 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0133038  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2586  hypothetical protein  29.85 
 
 		 201 aa  40.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>