29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0486 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0486  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1461    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0134972  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0380  SpoIID/LytB domain-containing protein  23.94 
 
 
686 aa  104  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000403516  hitchhiker  0.0000000000012381 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  26.4 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.43 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  22.09 
 
 
369 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  22.93 
 
 
708 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.77 
 
 
378 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  26.8 
 
 
558 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  23.28 
 
 
463 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  22.67 
 
 
369 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  26.84 
 
 
384 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1785  sporulation protein and related proteins-like  24.41 
 
 
526 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.450539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  25 
 
 
450 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  22.52 
 
 
321 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  25 
 
 
386 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  22.3 
 
 
380 aa  54.3  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  25.73 
 
 
381 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  23.84 
 
 
625 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  23.75 
 
 
391 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.33 
 
 
366 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  23.21 
 
 
421 aa  50.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  30.53 
 
 
291 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1318  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.46 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0300533  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  30.53 
 
 
291 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  30.53 
 
 
291 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  23.51 
 
 
391 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  22.36 
 
 
376 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  22.82 
 
 
454 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  22.34 
 
 
391 aa  43.9  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>