17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4387 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4435  hypothetical protein  61.14 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4438  hypothetical protein  61.14 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4321  putative cytoplasmic protein  60.87 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4351  hypothetical protein  60.7 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0042  putative cytoplasmic protein  25.12 
 
 		 415 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0040  hypothetical protein  25.35 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  hitchhiker  0.00714315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0042  putative cytoplasmic protein  25.12 
 
 		 415 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.814834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0041  putative cytoplasmic protein  25.35 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.241451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0040  hypothetical protein  25.64 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0016  hypothetical protein  24.75 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1508  putative cytoplasmic protein  23.06 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  21.87 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  23.27 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  22.55 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2860  hypothetical protein  22.66 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  22.03 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>