13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1160 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  97.27 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1832  hypothetical protein  98.16 
 
 		 163 aa  330  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000237524  hitchhiker  0.0000000000000361033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3167  hypothetical protein  98.16 
 
 		 163 aa  330  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1776  hypothetical protein  92.55 
 
 		 173 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01528  hypothetical protein  92.55 
 
 		 173 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2060  hypothetical protein  90.68 
 
 		 173 aa  300  8.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01537  predicted protein  93.62 
 
 		 153 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0462017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2075  conserved hypothetical protein  89.25 
 
 		 96 aa  176  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0310999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01529  hypothetical protein  89.36 
 
 		 94 aa  176  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0279595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1388  hypothetical protein  45.38 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.662888  hitchhiker  5.90722e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  27.78 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  26.71 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>