13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1423 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  97.27 
 
 
183 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1832  hypothetical protein  97.55 
 
 
163 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000237524  hitchhiker  0.0000000000000361033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3167  hypothetical protein  97.55 
 
 
163 aa  329  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01528  hypothetical protein  91.3 
 
 
173 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1776  hypothetical protein  91.3 
 
 
173 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2060  hypothetical protein  90.68 
 
 
173 aa  298  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01537  predicted protein  92.2 
 
 
153 aa  265  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0462017  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2075  conserved hypothetical protein  90.32 
 
 
96 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0310999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01529  hypothetical protein  90.43 
 
 
94 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0279595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1388  hypothetical protein  47.06 
 
 
164 aa  104  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.662888  hitchhiker  5.90722e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  27.78 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  26.71 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>