12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3167 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1832  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000237524  hitchhiker  0.0000000000000361033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3167  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  335  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  98.16 
 
 
183 aa  330  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  97.55 
 
 
183 aa  329  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01537  predicted protein  94.33 
 
 
153 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0462017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01528  hypothetical protein  94.33 
 
 
173 aa  270  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1776  hypothetical protein  94.33 
 
 
173 aa  270  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2060  hypothetical protein  92.2 
 
 
173 aa  265  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.280149  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2075  conserved hypothetical protein  91.78 
 
 
96 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0310999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01529  hypothetical protein  91.89 
 
 
94 aa  140  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0279595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1388  hypothetical protein  47.52 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.662888  hitchhiker  5.90722e-17 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  27.97 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>