11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01537 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01537  predicted protein  100 
 
 		 153 aa  313  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0462017  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01528  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  313  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0345418  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1776  hypothetical protein  99.35 
 
 		 173 aa  311  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2060  hypothetical protein  96.08 
 
 		 173 aa  303  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.280149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1832  hypothetical protein  94.33 
 
 		 163 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000237524  hitchhiker  0.0000000000000361033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3167  hypothetical protein  94.33 
 
 		 163 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  hitchhiker  9.41038e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1160  hypothetical protein  93.62 
 
 		 183 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000194771  hitchhiker  8.03326e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1423  hypothetical protein  92.2 
 
 		 183 aa  265  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000240373  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01529  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  151  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0279595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2075  conserved hypothetical protein  97.26 
 
 		 96 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0310999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1388  hypothetical protein  46.53 
 
 		 164 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.662888  hitchhiker  5.90722e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>