33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2134 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2134  haemolysin expression modulating protein  100 
 
 
58 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4886  haemolysin expression modulating protein  98.28 
 
 
58 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3334  haemolysin expression modulating protein  86.36 
 
 
46 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0086  hypothetical protein  56.36 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.316924 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0004  hypothetical protein  56.36 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000606592  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0060  virulence modulating protein  58.7 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.158481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1008  hemolysin expression-modulating protein  63.04 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3052  hemolysin expression-modulating protein  60.87 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.029809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3246  hemolysin expression-modulating protein  58.7 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1065  hemolysin expression-modulating protein  58.7 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1118  hemolysin expression-modulating protein  58.7 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524587  unclonable  0.00000000811136 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3156  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
76 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0533  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.150441  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00411  modulator of gene expression, with H-NS  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3150  hemolysin expression modulating family protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.483952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0940  hemolysin expression-modulating protein  54.55 
 
 
72 aa  57.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00416  hypothetical protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0550  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.655307  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0517  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000983246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0514  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000755855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0576  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0731512  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0523  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0220013  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0392  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0536  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0503  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3073  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000183634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3214  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00381272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3034  hemolysin expression-modulating protein  56.52 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000595952  normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0085  hypothetical protein  54.35 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143108  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0005  hypothetical protein  54.35 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000926061  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0277  hypothetical protein  53.33 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.298788  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0005  hypothetical protein  41.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0044  haemolysin expression modulating protein  42.42 
 
 
68 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.122459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>