11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0316 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0316  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  639    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3586  hypothetical protein  89.07 
 
 		 176 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000576065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0645  gp26  55.35 
 
 		 233 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.193156 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0407  head completion protein  54.09 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000945256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0677  hypothetical protein  40.28 
 
 		 170 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0760  hypothetical protein  40.28 
 
 		 170 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  31.68 
 
 		 963 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  26.72 
 
 		 257 aa  46.6  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  25.45 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0789  hypothetical protein  22.02 
 
 		 193 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.591318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2266  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1250 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>