8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0023 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00021  putative usher protein  98.52 
 
 		 1146 bp  2137    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.102676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0023    100 
 
 		 1146 bp  2272    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000130869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0019    99.5 
 
 		 1008 bp  1959    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000307086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3634    98.6 
 
 		 1353 bp  2145    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0589548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0021    97.85 
 
 		 375 bp  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0022    96.82 
 
 		 1902 bp  1033    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.210619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00022  hypothetical protein  98.51 
 
 		 1008 bp  1879    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3092  fimbrial usher protein  85 
 
 		 2481 bp  48.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>