24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5340 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5340  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.457333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4095  conserved hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4369  hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4128  hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4418  hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4117  hypothetical protein  91.25 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03724  hypothetical protein  90.28 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03775  hypothetical protein  90.28 
 
 		 72 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4276  hypothetical protein  88.89 
 
 		 72 aa  133  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0052  hypothetical protein  45.59 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.215127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4093  hypothetical protein  37.33 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4273  hypothetical protein  37.33 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3430  hypothetical protein  37.33 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1061  helix-turn-helix protein, CopG  35.71 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2081  putative transcriptional regulator, CopG family  36.62 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1952  helix-turn-helix protein, CopG  35.14 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146376  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1141  hypothetical protein  32.86 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03774  predicted transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03723  hypothetical protein  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5339  ribbon-helix-helix protein, copG family  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.463025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4096  transcriptional regulator, CopG family  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4129  CopG family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.811917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4115  CopG family protein  41.1 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4275  CopG family protein  41.38 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>