15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4275 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4275  CopG family protein  100 
 
 		 72 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03774  predicted transcriptional regulator  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4096  transcriptional regulator, CopG family  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4115  CopG family protein  95.83 
 
 		 81 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4129  CopG family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.811917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5339  ribbon-helix-helix protein, copG family  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.463025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03723  hypothetical protein  95.83 
 
 		 72 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5340  hypothetical protein  41.38 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.457333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4095  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4117  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4418  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4128  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4369  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03775  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03724  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>