18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1141 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1141  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2081  putative transcriptional regulator, CopG family  45.07 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1061  helix-turn-helix protein, CopG  45.07 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4273  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4093  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3430  hypothetical protein  41.43 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5340  hypothetical protein  32.86 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.457333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4276  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0052  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.215127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03724  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03775  hypothetical protein  34.29 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4369  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4128  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4418  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4095  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1200  CopG-like DNA-binding protein  39.19 
 
 		 82 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.076624  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1952  helix-turn-helix protein, CopG  34.29 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146376  normal  0.657795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>