18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4093 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4273  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1061  helix-turn-helix protein, CopG  50 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1952  helix-turn-helix protein, CopG  56.94 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146376  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4494  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4276  hypothetical protein  38.67 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5340  hypothetical protein  37.33 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.457333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0052  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.215127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03724  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03775  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4369  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4128  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4418  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4117  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4095  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1141  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2081  putative transcriptional regulator, CopG family  36.49 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>