17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3220 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  328  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.255353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2649  hypothetical protein  86.18 
 
 		 158 aa  254  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3228  putative bacteriophage-related protein  74 
 
 		 154 aa  242  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000377151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2840  hypothetical protein  64.19 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1240  hypothetical protein  63.51 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2069  putative bacteriophage-related protein  60.93 
 
 		 166 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245139  normal  0.0319755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1305  hypothetical protein  63.27 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.158777  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2765  putative bacteriophage-related protein  62.59 
 
 		 166 aa  190  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.363504  normal  0.068454 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2914  hypothetical protein  60.81 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.340739  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2600  hypothetical protein  61.9 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.404995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0818  hypothetical protein  57.66 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.691649  hitchhiker  0.00112979 
 
 
-
 
NC_002978  WD0262  hypothetical protein  58.95 
 
 		 108 aa  130  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3569  putative bacteriophage-related protein  30.52 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0261  hypothetical protein  61.9 
 
 		 46 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6984  putative bacteriophage-related protein  32.19 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4090  putative bacteriophage-related protein  34.64 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6274  putative bacteriophage-related protein  33.56 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>