51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2792 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2792  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  792    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175599  normal  0.656864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1929  toxic anion resistance  76.77 
 
 
396 aa  587  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2264  tellurite resistance protein  73.6 
 
 
396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0938  toxic anion resistance family protein  73.86 
 
 
396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308205  normal  0.403453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1852  toxic anion resistance  75.75 
 
 
400 aa  550  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.263274  normal  0.0294888 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2233  toxic anion resistance family protein  73.86 
 
 
396 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000201164  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2951  toxic anion resistance family protein  73.37 
 
 
397 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.586905  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0848  toxic anion resistance family protein  39.76 
 
 
439 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.571741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2243  toxic anion resistance family protein  41.39 
 
 
396 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1993  toxic anion resistance family protein  38.81 
 
 
396 aa  239  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00104364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1971  toxic anion resistance family protein  39.04 
 
 
368 aa  237  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  35.89 
 
 
386 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0411132  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1496  toxic anion resistance family protein  34.74 
 
 
378 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1467  toxic anion resistance family protein  34.74 
 
 
378 aa  217  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.999739  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0976  tellurite resistance protein, putative  32.14 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1459  hypothetical protein  34.25 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0195  toxic anion resistance family protein  33.81 
 
 
367 aa  199  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1660  tellurite resistance protein  33.33 
 
 
379 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1579  toxic anion resistance family protein  31.76 
 
 
358 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.818235  normal  0.519826 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06500  hypothetical protein  31.8 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1941  toxic anion resistance family protein  29.5 
 
 
365 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.0249977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2845  toxic anion resistance family protein  27.5 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0469  putative tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0518  tellurite resistance protein, putative  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0518  tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4855  putative tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00435567  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0448  putative tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1369  hypothetical protein  31.22 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0390  tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00957794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0404  tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0381  tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00380855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0378  tellurite resistance protein  26.84 
 
 
360 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.992668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0389  toxic anion resistance family protein  26.3 
 
 
360 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0384  toxic anion resistance family protein  26.47 
 
 
360 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1598  toxic anion resistance family protein  26.35 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0659  toxic anion resistance family protein  25.41 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.840124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5507  toxic anion resistance  26.51 
 
 
378 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407943  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3493  toxic anion resistance family protein  22.11 
 
 
405 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603001  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3316  toxic anion resistance family protein  22.9 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1786  toxic anion resistance family protein  21.34 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2475  hypothetical protein  20.32 
 
 
370 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2916  hypothetical protein  20.57 
 
 
387 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.233445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  21.33 
 
 
399 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2208  hypothetical protein  20.57 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0466629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2250  hypothetical protein  20.57 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00532335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2414  hypothetical protein  20.57 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2287  hypothetical protein  20.57 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2555  hypothetical protein  20.57 
 
 
370 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2458  hypothetical protein  20.57 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2491  hypothetical protein  20.57 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000702786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2266  toxic anion resistance family protein  20.32 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0678634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>