56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1929 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1929  toxic anion resistance  100 
 
 		 396 aa  790    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.613644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2792  hypothetical protein  76.77 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175599  normal  0.656864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0938  toxic anion resistance family protein  71.57 
 
 		 396 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.308205  normal  0.403453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2264  tellurite resistance protein  71.32 
 
 		 396 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1852  toxic anion resistance  73.89 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.263274  normal  0.0294888 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2951  toxic anion resistance family protein  73.3 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.586905  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2233  toxic anion resistance family protein  70.56 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.000201164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0848  toxic anion resistance family protein  40.8 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.571741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2243  toxic anion resistance family protein  40.52 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1971  toxic anion resistance family protein  37.36 
 
 		 368 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1993  toxic anion resistance family protein  38.1 
 
 		 396 aa  229  9e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00104364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1467  toxic anion resistance family protein  34.04 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.999739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1496  toxic anion resistance family protein  34.04 
 
 		 378 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.379081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  35.11 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0411132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0195  toxic anion resistance family protein  35.63 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0976  tellurite resistance protein, putative  33.85 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1660  tellurite resistance protein  34.69 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1459  hypothetical protein  34.25 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00202745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1579  toxic anion resistance family protein  36 
 
 		 358 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.818235  normal  0.519826 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 352 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1941  toxic anion resistance family protein  28.22 
 
 		 365 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.0249977 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0389  toxic anion resistance family protein  27.75 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2845  toxic anion resistance family protein  29.72 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0469  putative tellurite resistance protein  26.61 
 
 		 360 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0518  tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4855  putative tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00435567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0448  putative tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0518  tellurite resistance protein, putative  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0390  tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00957794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0381  tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00380855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0378  tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.992668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0404  tellurite resistance protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0384  toxic anion resistance family protein  26.33 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1369  hypothetical protein  29.71 
 
 		 289 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0659  toxic anion resistance family protein  24.79 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.840124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1598  toxic anion resistance family protein  25.23 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5507  toxic anion resistance  27.22 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3493  toxic anion resistance family protein  24.78 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603001  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1823  hypothetical protein  20.92 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1786  toxic anion resistance family protein  22.53 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2266  toxic anion resistance family protein  22.53 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0678634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2414  hypothetical protein  22.13 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2959  toxic anion resistance  27.09 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.982902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2555  hypothetical protein  22.13 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2458  hypothetical protein  22.13 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2916  hypothetical protein  22.13 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.233445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2208  hypothetical protein  22.13 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0466629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2250  hypothetical protein  22.13 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00532335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2287  hypothetical protein  22.13 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0180741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0765  toxic anion resistance family protein  21.62 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3316  toxic anion resistance family protein  22.05 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2491  hypothetical protein  22.13 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000702786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2475  hypothetical protein  21.34 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6387  toxic anion resistance family protein  22.94 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550341  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37530  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  23.33 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3058  toxic anion resistance family protein  23.43 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000145749 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>