23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2476 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2476  GlpM protein  100 
 
 		 117 aa  225  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0576  glpM protein  37.74 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2050  GlpM protein  26.13 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00204107  hitchhiker  0.00420022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2378  GlpM family protein  35.56 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.478096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4424  GlpM family protein  28.44 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2358  GlpM family protein  25.93 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2255  GlpM protein  25.93 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000704437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4143  GlpM family protein  29.13 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4541  GlpM  25.96 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.300436  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2468  GlpM family protein  30.77 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.691843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1106  GlpM family protein  30.53 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659945  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1845  GlpM family protein  27.27 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1065  GlpM family protein  29.47 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4347  GlpM family protein  29.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06572  hypothetical protein  29.76 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1682  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.415334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1814  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0297907  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2023  GlpM family protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1792  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0167056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2316  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01566  hypothetical protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2036  GlpM family protein  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000115017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01576  conserved inner membrane protein associated with alginate biosynthesis  28.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.612551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>