18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1075 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1075  metal dependent phophohydrolase  100 
 
 
203 aa  424  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.441116  normal  0.194758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0365  metal dependent phosphohydrolase  50 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0137  metal dependent phosphohydrolase  50.76 
 
 
209 aa  191  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.150838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2650  metal dependent phosphohydrolase  48.28 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.601776  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2275  metal dependent phosphohydrolase  48.09 
 
 
245 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0871  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 
218 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4103  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
196 aa  91.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  0.413564 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 
393 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  28.25 
 
 
373 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
389 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
591 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  35.44 
 
 
168 aa  48.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
367 aa  46.6  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  30.49 
 
 
363 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1293  phosphodiesterase  34.48 
 
 
517 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000703284  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0550  phosphodiesterase  29.87 
 
 
509 aa  41.6  0.008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0114  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
520 aa  41.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.67 
 
 
368 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>