16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2397 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2397  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0699  flagellar biosynthesis protein FliO  39.29 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13505  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1754  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0785  hypothetical protein  31.91 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000370411  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2034  flagellar biosynthetic protein FliO  39.45 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  32.53 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3825  putative flagellar biogenesis protein  32.18 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  44.9 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  30 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  27.62 
 
 
163 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0864  hypothetical protein  30 
 
 
210 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2158  hypothetical protein  38.16 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  38.78 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1678  hypothetical protein  27.42 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.45 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  36.62 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>