24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3825 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3825  putative flagellar biogenesis protein  100 
 
 		 159 aa  307  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3909  putative flagellar biogenesis protein  89.94 
 
 		 159 aa  273  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00889452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4200  hypothetical protein  54.69 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3098  hypothetical protein  55.75 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3291  hypothetical protein  48.8 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3439  hypothetical protein  49.47 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1167  flagellar biogenesis protein FliO  41.28 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.64 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1335  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.3 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  33.33 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  39.71 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2397  hypothetical protein  32.74 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  34.34 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  34.62 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  40.62 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  33.72 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  33.73 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  39.39 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  37.88 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  29.29 
 
 		 140 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0500  hypothetical protein  26.67 
 
 		 224 aa  41.6  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.43 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  32.89 
 
 		 127 aa  40.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>